OA論文を既存のオントロジーで「セマンティック」に検索できる生命科学分野のデータベース“BioLit”

米国カリフォルニア大学サンディエゴ校の研究グループが、オープンアクセスの生命科学論文を、“Open Biomedical Ontologies”で公開されている既存のオントロジー(両生類の骨格、マウスの病理学、ヒトの病気、等)を用いて「セマンティック」に検索できるデータベース“BioLit”を作成・公開しています。データをXML形式で取り出すことも可能であり、オントロジーのパーサーの公開も予定されています。なお現在(2008年10月2日時点)は、PubMed Centralに収録されている論文、約6万5,000が対象になっています。

BioLit
http://biolit.ucsd.edu/

Open Biomedical Ontologies
http://obofoundry.org/

September 26, 2008付けPeter Scott’s Library Blogの記事
http://xrefer.blogspot.com/2008/09/biolit.html